પ્રેગાબાલિન એ GABAA અથવા GABAB રીસેપ્ટર એગોનિસ્ટ નથી.
પ્રેગાબાલિન એ ગેબાપેન્ટિનોઇડ છે અને અમુક કેલ્શિયમ ચેનલોને અટકાવીને કાર્ય કરે છે.ખાસ કરીને તે ચોક્કસ વોલ્ટેજ-આધારિત કેલ્શિયમ ચેનલો (VDCCs) ની સહાયક α2δ સબ્યુનિટ સાઇટનું લિગાન્ડ છે, અને ત્યાંથી α2δ સબ્યુનિટ-સમાવતી VDCCs ના અવરોધક તરીકે કાર્ય કરે છે.ત્યાં બે ડ્રગ-બંધનકર્તા α2δ સબ્યુનિટ્સ છે, α2δ-1 અને α2δ-2, અને પ્રેગાબાલિન આ બે સાઇટ્સ માટે સમાન સંબંધ દર્શાવે છે (અને તેથી વચ્ચે પસંદગીનો અભાવ).પ્રેગાબાલિન α2δ VDCC સબ્યુનિટ સાથે બંધનમાં પસંદગીયુક્ત છે.પ્રેગાબાલિન એ GABA એનાલોગ હોવા છતાં, તે GABA રીસેપ્ટર્સ સાથે બંધનકર્તા નથી, GABA અથવા વિવોમાં અન્ય GABA રીસેપ્ટર એગોનિસ્ટમાં રૂપાંતરિત થતું નથી, અને GABA પરિવહન અથવા ચયાપચયને સીધી રીતે મોડ્યુલેટ કરતું નથી.જો કે, પ્રિગાબાલિન L-glutamic એસિડ ડેકાર્બોક્સિલેઝ (GAD) ના મગજની અભિવ્યક્તિમાં ડોઝ-આશ્રિત વધારો ઉત્પન્ન કરતું જોવા મળ્યું છે, જે GABA ને સંશ્લેષણ કરવા માટે જવાબદાર એન્ઝાઇમ છે, અને તેથી મગજમાં GABA સ્તર વધારીને કેટલીક પરોક્ષ GABAergic અસરો હોઈ શકે છે.હાલમાં એવા કોઈ પુરાવા નથી કે પ્રેગાબાલિનની અસરો α2δ-સમાવતી VDCCs ના નિષેધ સિવાયની કોઈપણ પદ્ધતિ દ્વારા મધ્યસ્થી કરવામાં આવે છે.તે મુજબ, પ્રીગાબાલિન દ્વારા α2δ-1-સમાવતું VDCCs નું નિષેધ તેની એન્ટિકોનવલ્સન્ટ, એનાલજેસિક અને ચિંતાજનક અસરો માટે જવાબદાર હોવાનું જણાય છે.
અંતર્જાત α-એમિનો એસિડ્સ L-leucine અને L-isoleucine, જે રાસાયણિક બંધારણમાં પ્રેગાબાલિન અને અન્ય ગેબાપેન્ટિનોઇડ્સ સાથે નજીકથી મળતા આવે છે, તે gabapentinoids (દા.ત., IC50 = 71 nM L-L માટે સમાન જોડાણ સાથે α2δ VDCC સબ્યુનિટના સ્પષ્ટ લિગાન્ડ્સ છે. આઇસોલ્યુસીન), અને માનવ સેરેબ્રોસ્પાઇનલ પ્રવાહીમાં માઇક્રોમોલર સાંદ્રતામાં હાજર છે (દા.ત., એલ-લ્યુસીન માટે 12.9 μM, એલ-આઇસોલ્યુસીન માટે 4.8 μM).એવું માનવામાં આવે છે કે તેઓ સબ્યુનિટના અંતર્જાત લિગાન્ડ્સ હોઈ શકે છે અને તેઓ સ્પર્ધાત્મક રીતે ગેબાપેન્ટિનોઇડ્સની અસરોનો વિરોધ કરી શકે છે.અનુરૂપ, જ્યારે પ્રેગાબાલિન અને ગેબાપેન્ટિન જેવા ગેબાપેન્ટિનોઇડ્સ α2δ સબ્યુનિટ માટે નેનોમોલર જોડાણ ધરાવે છે, ત્યારે વિવોમાં તેમની ક્ષમતા ઓછી માઇક્રોમોલર શ્રેણીમાં છે, અને અંતર્જાત L-એમિનો એસિડ્સ દ્વારા બંધન કરવાની સ્પર્ધા આ વિસંગતતા માટે જવાબદાર હોવાનું કહેવાય છે.

એક અભ્યાસમાં α2δ સબ્યુનિટ-સમાવતી VDCCs માટે પ્રેગાબાલિનમાં ગાબાપેન્ટિન કરતાં 6 ગણો વધુ આકર્ષણ હોવાનું જણાયું હતું.જો કે, અન્ય એક અભ્યાસમાં જાણવા મળ્યું છે કે પ્રેગાબાલિન અને ગેબાપેન્ટિન માનવ રિકોમ્બિનન્ટ α2δ-1 સબ્યુનિટ (અનુક્રમે Ki = 32 nM અને 40 nM) માટે સમાન સંબંધ ધરાવે છે.કોઈ પણ સંજોગોમાં, પ્રિગાબાલિન એ એનાલજેસિક તરીકે ગેબાપેન્ટિન કરતાં 2 થી 4 ગણું વધુ બળવાન છે અને પ્રાણીઓમાં, એન્ટિકોનવલ્સન્ટ તરીકે ગેબાપેન્ટિન કરતાં 3 થી 10 ગણું વધુ બળવાન જણાય છે.